Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX12Q9UMY4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX12Q9UMY4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX12Q9UMY4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX12Q9UMY4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX12Q9UMY4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms