Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO1Q9UM00 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO1Q9UM00 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO1Q9UM00 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO1Q9UM00 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO1Q9UM00 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO1Q9UM00 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMCO1Q9UM00 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO1Q9UM00 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO1Q9UM00 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO1Q9UM00 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO1Q9UM00 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO1Q9UM00 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO1Q9UM00 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO1Q9UM00 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO1Q9UM00 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO1Q9UM00 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms