Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP17Q9ULZ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP17Q9ULZ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms