Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIMKLBQ9ULI2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIMKLBQ9ULI2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIMKLBQ9ULI2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms