Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMP5Q9UJQ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMP5Q9UJQ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMP5Q9UJQ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms