Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIMS3Q9UJD0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMS3Q9UJD0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMS3Q9UJD0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms