Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC24A2Q9UI40 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC24A2Q9UI40 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC24A2Q9UI40 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC24A2Q9UI40 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms