Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX20Q9UHI6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX20Q9UHI6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX20Q9UHI6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms