Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CGGBP1Q9UFW8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGGBP1Q9UFW8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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