Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRODH2Q9UF12 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRODH2Q9UF12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRODH2Q9UF12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRODH2Q9UF12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms