Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CFDP1Q9UEE9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CFDP1Q9UEE9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
CFDP1Q9UEE9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CFDP1Q9UEE9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms