Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKX1-2Q9UD57 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX1-2Q9UD57 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX1-2Q9UD57 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms