Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4Q9UBN4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC4Q9UBN4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4Q9UBN4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4Q9UBN4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms