Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-18Q9QC07 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVK-18Q9QC07 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.7 ms