Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SLAIN2Q9P270 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SLAIN2Q9P270 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SLAIN2Q9P270 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SLAIN2Q9P270 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SLAIN2Q9P270 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SLAIN2Q9P270 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SLAIN2Q9P270 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SLAIN2Q9P270 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLAIN2Q9P270 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SLAIN2Q9P270 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms