Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFY2Q9P0M6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFY2Q9P0M6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms