Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL39Q9NYK5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL39Q9NYK5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL39Q9NYK5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL39Q9NYK5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms