Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC3Q9NYG2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC3Q9NYG2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms