Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWN3

FBXO34, F-box only protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO34Q9NWN3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO34Q9NWN3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO34Q9NWN3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO34Q9NWN3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms