Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SPTLC3Q9NUV7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPTLC3Q9NUV7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPTLC3Q9NUV7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC3Q9NUV7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms