Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC18Q9NUE0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
ZDHHC18Q9NUE0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZDHHC18Q9NUE0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZDHHC18Q9NUE0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZDHHC18Q9NUE0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZDHHC18Q9NUE0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZDHHC18Q9NUE0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZDHHC18Q9NUE0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZDHHC18Q9NUE0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZDHHC18Q9NUE0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZDHHC18Q9NUE0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZDHHC18Q9NUE0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZDHHC18Q9NUE0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms