Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RRP7BPQ9NSQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
RRP7BPQ9NSQ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
RRP7BPQ9NSQ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RRP7BPQ9NSQ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RRP7BPQ9NSQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RRP7BPQ9NSQ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms