Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LTBP3Q9NS15 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LTBP3Q9NS15 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LTBP3Q9NS15 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
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