Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPRSS4Q9NRS4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPRSS4Q9NRS4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMPRSS4Q9NRS4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms