Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE3Q9NRF9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLE3Q9NRF9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE3Q9NRF9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE3Q9NRF9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms