Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF3Q9NR23 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDF3Q9NR23 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDF3Q9NR23 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms