Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCFQ9NPI8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCFQ9NPI8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms