Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA2

MMP25, Matrix metalloproteinase-25, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP25Q9NPA2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP25Q9NPA2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP25Q9NPA2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP25Q9NPA2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms