Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALMDQ9NP74 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALMDQ9NP74 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALMDQ9NP74 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALMDQ9NP74 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALMDQ9NP74 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALMDQ9NP74 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PALMDQ9NP74 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALMDQ9NP74 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALMDQ9NP74 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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