Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP31

SH2D2A, SH2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D2AQ9NP31 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2D2AQ9NP31 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2D2AQ9NP31 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2D2AQ9NP31 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms