Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOPCQ9HD26 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GOPCQ9HD26 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOPCQ9HD26 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOPCQ9HD26 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms