Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PREBQ9HCU5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PREBQ9HCU5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PREBQ9HCU5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PREBQ9HCU5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms