Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCCC2Q9HCC0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCCC2Q9HCC0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCC2Q9HCC0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCC2Q9HCC0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms