Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC28A3Q9HAS3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC28A3Q9HAS3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC28A3Q9HAS3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC28A3Q9HAS3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC28A3Q9HAS3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC28A3Q9HAS3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167 ms