Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C8orf33Q9H7E9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C8orf33Q9H7E9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C8orf33Q9H7E9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf33Q9H7E9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms