Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRABDQ9H4I3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRABDQ9H4I3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRABDQ9H4I3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms