Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4AQ9H3S1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA4AQ9H3S1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4AQ9H3S1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4AQ9H3S1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms