Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP4Q9H3Q1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP4Q9H3Q1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP4Q9H3Q1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP4Q9H3Q1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP4Q9H3Q1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC42EP4Q9H3Q1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP4Q9H3Q1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42EP4Q9H3Q1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP4Q9H3Q1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP4Q9H3Q1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP4Q9H3Q1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP4Q9H3Q1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP4Q9H3Q1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms