Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCXQ9H320 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCXQ9H320 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms