Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF39Q9H2S5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF39Q9H2S5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF39Q9H2S5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF39Q9H2S5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF39Q9H2S5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF39Q9H2S5 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF39Q9H2S5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF39Q9H2S5 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF39Q9H2S5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF39Q9H2S5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF39Q9H2S5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF39Q9H2S5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms