Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM7Q9C029 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM7Q9C029 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM7Q9C029 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms