Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
NLRP1Q9C000 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NLRP1Q9C000 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NLRP1Q9C000 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NLRP1Q9C000 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 802 ms