Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TM6SF2Q9BZW4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM6SF2Q9BZW4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM6SF2Q9BZW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms