Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXP3Q9BZS1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXP3Q9BZS1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms