Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CELF4Q9BZC1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF4Q9BZC1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CELF4Q9BZC1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms