Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms