Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SGPP1Q9BX95 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGPP1Q9BX95 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGPP1Q9BX95 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGPP1Q9BX95 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms