Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV94

EDEM2, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM2Q9BV94 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDEM2Q9BV94 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDEM2Q9BV94 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDEM2Q9BV94 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM2Q9BV94 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms