Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms