Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PAGR1Q9BTK6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PAGR1Q9BTK6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAGR1Q9BTK6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAGR1Q9BTK6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms